商业秘密被侵犯如果和侵权人签订了保密协议，约定了仲裁条款的，可以向协议中约定的仲裁委申请仲裁；也可以直接向人民法院起诉；还可以向工商行政管理部门投诉。
一、合伙人纠纷怎么样通过法律解决
（1)协商解决
(2)通过第三者调解解决。
(3)申请仲裁：不愿通过协商、调解解决或者协商、调解不成的，可以按照合伙协议约定的仲裁条款或者事后达成的书面仲裁协议，向仲裁机构申请仲裁。
(4)诉讼途径解决：合伙协议中未订立仲裁条款，事后又没有达成书面仲裁协议的，可以向人民法院起诉。
二、商铺租赁合同纠纷
商铺租赁合同纠纷，当事人可以通过协商的方式处理。一方当事人也可以直接到人民法院起诉。但是如果租赁合同中有有效的仲裁条款，应先到约定的仲裁委申请仲裁。
《民事诉讼法》第一百二十条规定，起诉应当向人民法院递交起诉状，并按照被告人数提出副本。
书写起诉状确有困难的，可以口头起诉，由人民法院记入笔录，并告知对方当事人。
《仲裁法》第四条规定，当事人采用仲裁方式解决纠纷，应当双方自愿，达成仲裁协议。没有仲裁协议，一方申请仲裁的，仲裁委员会不予受理。
【本文关联的相关法律依据】
《刑法》第二百一十九条
有下列侵犯商业秘密行为之一，给商业秘密的权利人造成重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；造成特别严重后果的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金：
(一)以盗窃、利诱、胁迫或者其他不正当手段获取权利人的商业秘密的；
(二)披露、使用或者允许他人使用以前项手段获取的权利人的商业秘密的；
(三)违反约定或者违反权利人有关保守商业秘密的要求，披露、使用或者允许他人使用其所掌握的商业秘密的。明知或者应知前款所列行为，获取、使用或者披露他人的商业秘密的，以侵犯商业秘密论。
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